与现行本式往来港澳通行证不同，2014版往来港澳通行证是参照国际标准设计制作的卡式证件，往来港澳签注不再采取贴纸的方式，而是直接打印在证件背面(可以重复擦写)。电子往来港澳通行证正面、背面分别印有长城和紫荆花、莲花图案，辅以传统的祥云装饰纹，使用了双色套印、光变油墨等十几项物理防伪技术，正面还覆有激光全息防伪膜。证件背面的签注信息除了文字内容外，还印有二维码。与电子普通护照相似，电子往来港澳通行证内部嵌有非接触式集成电路芯片，存储持证人个人资料及证件、签注签发管理信息。