当公司利益受到损害时，少数股东代表股东提起诉讼，被告不是公司的控股股东。日前，北京市海淀区人民法院审结了一起股东损害公司利益案，支持原告小股东的诉讼请求，判令被告控股股东向第三方公司返还贪污资金189.44万余元，并赔偿损失利息损失。法官在判决书中还首次认定，股东代表诉讼时效期间从修改后的《公司法》生效之日起计算，而不是从权利人知道利益受到侵害之日起计算，从而保护公司和其他股东的利益。原告林某和被告a科技公司是北京某**卡公司的股东，分别持有该公司15%和35%的股份。2002年底，**卡公司被工商行政管理部门吊销营业执照。2003年，林某提起了清算诉讼。2004年10月14日，北京市第一中级人民法院判决林先生伙同科技公司及**卡公司其他两名股东对**卡公司进行清算。在案件执行过程中，海淀区法院委托会计师事务所对公司2001年3月26日的资产负债表及成立以来的收支情况进行了核查确认。会计师事务所出具审计报告，认定科技公司占用公司资金170万元，公司因违规支付的不合格费用19.44万元，应当向科技公司负责人追缴。此外，2002年10月，会计师事务所受公司另一股东委托，对公司成立以来的资产负债表及收支情况进行了核查。经查，该公司于1999年10月8日成立之初，将收入170万元转入科技公司，形成其他应收款。林先生得知情况后，于2002年11月6日致函该科技公司，要求妥善解决智能卡工程公司提取注册资本170万元等问题。

在诉讼中，科技公司辩称，2002年11月6日，林某发现科技公司已收回贷款170万元。本案诉讼时效从2002年11月6日起计算，现已超过两年时效，请求法院驳回林某的诉讼请求。