侵害商标权纠纷的意思是：商标注册人的注册商标专用权的侵犯行为和对注册商标所有人的商业信誉，经营效益造成巨大损害的侵权行为的一种纠纷。应由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。

侵害商标权纠纷法院是怎么判的

1、责令侵权人立即停止侵害。可以销毁构成侵权行为的物品，拆除侵权行为所用的设备，收邀直接专门用于侵权行为的工具、模板等；

2、消除影响，恢复被侵权人的信誉，如责令被侵权人在报刊杂志上登载道歉声明等，以恢复被侵权人的商业信誉；

3、赔偿被侵权人的损失，赔偿额的计算办法为侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润或者被侵权人在被侵权期间因被侵权所受到的损失。另外，被侵权人因调查、取证、聘请诉讼代理人或非诉讼代理人所花的费用，侵权人也应予以赔偿；

4、除上述主要办法外，人民法院还可以采取训诫、责令具结悔过、没收非法所得、罚款或拘留等措施。

《商标法》第六十条

有本法第五十七条所列侵犯注册商标专用权行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。

工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。