保税区内企业优惠政策主要有：

1、海关对区内加工企业进料加工、来料加工业务，不实行加工贸易银行保证金台帐制度。

2、保税区与境外之间进出的货物，除实行出口被动配额管理的外，不实行进出口配额、许可证件管理。

3、区内加工企业加工的制成品及其在加工过程中产生的边角余料运往境外时，除法律、行政法规另有规定外，免征出口关税。

4、区内企业为加工出口产品所需的原材料、零部件、元器件、包装物件，予以保税。

5、区内企业自用的生产、管理设备和自用合理数量的办公用品及其所需的维修零配件，生产用燃料，建设生产厂房、仓储设施所需的物资、设备，予以免税。