店铺侵权商标违规会被判处支付民事赔偿金。

(1)商标侵权的诉讼时效——两年。侵犯注册商标专用权的诉讼时效为二年。

(2)商标侵权的诉讼时效起算——知道或者应当知道侵权行为之日起计算。侵犯注册商标专用权的诉讼时效为二年，自商标注册人或者利害权利人知道或者应当知道侵权行为之日起计算。商标注册人或者利害关系人超过二年起诉的，如果侵权行为在起诉时仍在持续，在该注册商标专用权有效期限内，人民法院应当判决被告停止侵权行为，侵权损害赔偿数额应当自权利人向人民法院起诉之日起向前推算二年计算。

一、关于商标侵权赔偿数额的确定方法

根据本条的规定，侵犯注册商标专用权的赔偿数额，按照以下顺序和方式确定：

第一，按“实际损失”确定赔偿数额。即侵犯商标专用权的赔偿数额，按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定。按照2002年10月12日《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，“因被侵权所受到的损失”，可以“根据权利人因侵权所造成商品销售减少量或者侵权商品销售量与该注册商标商品的单位利润乘积计算”。对恶意侵犯商标专用权、情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的1倍以上3倍以下确定赔偿数额。

此外，在按上述方式确定赔偿数额后，还应当加上注册商标权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。所谓“合理开支”，按照《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，“包括权利人或者委托代理人对侵权行为进行调查、取证的合理费用”，“人民法院根据当事人的诉讼请求和案件具体情况，可以将符合国家有关部门规定的律师费用计算在赔偿范围内”。

第二，按“因侵权所获得的利益”确定赔偿数额。即在注册商标权利人的实际损失难以确定的情况下，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。按照《最高人民法院关于审理商标民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》的规定，“侵权所获得的利益”，可以“根据侵权商品销售量与该商品单位利润乘积计算”，“该商品单位利润无法查明的，按照注册商标商品的单位利润计算”。对恶意侵犯商标专用权、情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的1倍以上3倍以下确定赔偿数额。此外，在按上述方式确定赔偿数额后，还应当加上注册商标权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

第三，按“商标许可使用费的倍数”确定赔偿数额。即在权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的情况下，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权、情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的1倍以上3倍以下确定赔偿数额。此外，在按上述方式确定赔偿数额后，还应当加上注册商标权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

第四，由法院“参考权利人的主张和提供的证据”判定赔偿数额。即人民法院为确定赔偿数额，在权利人已经尽力举证，而与侵权行为相关的账簿、资料主要由侵权人掌握的情况下，可以责令侵权人提供与侵权行为相关的账簿、资料；侵权人不提供或者提供虚假的账簿、资料的，人民法院可以参考权利人的主张和提供的证据判定赔偿数额。