1、商标纠纷提交人民法院后，当事人同意人民法院调解的，应当出具调解协议，调解协议具有法律效力。根据《中华人民共和国民事诉讼法》第九十三条的规定，人民法院审理民事案件，应当根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。第九十七条调解达成协议的，人民法院应当作出调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件事实和调解结果。调解书由审判员、书记员签名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。双方当事人签收调解书后，具有法律效力。二是工商行政管理部门如何解决商标纠纷

县级以上工商行政管理部门在受理赠送商标侵权案件后，应当在调查取证的前提下，停止侵权行为认定事实，并根据侵权事实和情节轻重作出行政处罚。具体处罚措施包括：1、责令立即停止销售；2、接受邀请，销毁侵权商标标识；3、消除现有商标上的侵权商标；4、接受模具邀请，直接用于商标侵权的印版或者其他犯罪工具；

5、责令、监督销毁物品；

6。根据情节，可以处以非法经营额50%以下或者侵权所得利润5倍以下的罚款，并可以责令侵权人赔偿被侵权人的损失。对侵犯注册商标专用权的，商务行政部门在调查取证中可以行使下列职权：。询问有关各方；

2。检查与侵权活动有关的物品，必要时责令封存；3。调查与侵权活动有关的行为。查阅、复制与侵权活动有关的合同、账簿等业务资料。