宅基地被他人侵占的可以先协商，无法协商由人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第十四条

土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

宅基地被侵占可以直接起诉吗

宅基地被侵占可以直接起诉。当宅基地被他人恶意侵占，权利人可以通过以下三种方式维权：第一，与直接侵权人协商处理，要求停止侵权行为；第二，找当地村委会，派出所进行调解处理；第三，收集侵权的证据，然后去法院起诉，要求停止侵权，排除妨碍。农村宅基地被侵占首先应提供合法宅基地证据，如属合法宅基地，那么被侵占就是不合法的，此时可以用以上三种方式进行维权。