一、限制期限不同

根据我国《劳动法》的规定，一般而言保护商业秘密的责任是无期限的，即劳动者在与公司签订保护商业秘密协议后就有义务终身不得泄露公司的商业秘密，及时在离开公司后也得继续为其保密知道该商业秘密完全被公开或者被认定为不在是商业秘密后劳动者才可以不遵守相应的规定;而竞业禁止则是对劳动者的限制一般情况下是指最高在三年内不得从事与原工作有关的行业。之所以对劳动者提出这样的要求就是害怕劳动者与企业形成恶性竞争，有时间限制的原因在于这样才能保障劳动者的利益。

二、是否支付相应的报酬

一般而言商业秘密的保密义务是没有相应的报酬的，其原因就在于商业秘密的重要性，对于有些特殊行业而言保守商业秘密是劳动者进入该行业的基础，当劳动者在选择从事相关行业其后就必须接受该项义务，因而不得因没有给予一定的保密费为由而泄露商业秘密。而竞业禁止则不同，提出竞业禁止要求的企业要给予劳动者一定的报酬，原因在于竞业禁止使得劳动者靠原有的技能不能从事相应的工作，这样肯定会影响到劳动者的生活水平，因而要求要企业给予一定的对价支出。