非法运输危险物质罪的立案标准，具体如下：1、造成人员重伤或者死亡的；2、造成直接经济损失十万元以上的；3、非法制造、买卖、运输、储存毒鼠强、氟乙酰胺、氟乙酰钠、毒鼠硅、甘氟原粉、原液、制剂五十克以上，或者饵料二千克以上的；4、造成急性中毒、放射性疾病或者造成传染病流行、暴发的。

非法运输危险物质罪既遂如何判刑？

根据我国刑法的规定，非法运输危险物质罪既遂法院的判刑是：处三年以上十年以下有期徒刑；如果存在严重犯罪情节的，则应判处十年以上有期、无期或死刑；如果单位犯本罪应对其判处罚金，并对其相关责任人员判处个人犯罪相应。

《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第二条［非法制造、买卖、运输、储存危险物质案（刑法第一百二十五条第二款）］非法制造、买卖、运输、储存毒害性、放射性、传染病病原体等物质，危害公共安全，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：

（一）造成人员重伤或者死亡的；

（二）造成直接经济损失十万元以上的；

（三）非法制造、买卖、运输、储存毒鼠强、氟乙酰胺、氟乙酰钠、毒鼠硅、甘氟原粉、原液、制剂五十克以上，或者饵料二千克以上的；

（四）造成急性中毒、放射性疾病或者造成传染病流行、暴发的；

（五）造成严重环境污染的；

（六）造成毒害性、放射性、传染病病原体等危险物质丢失、被盗、被抢或者被他人利用进行违法犯罪活动的；

（七）其他危害公共安全的情形。