1、概念不同

投敌叛变罪是指中国公民投奔敌方或者敌对营垒，或者在被捕、被俘或者由于其他原因被敌方控制以后投降敌人，危害中华人民共和国国家安全的行为。

叛逃罪是指国家机关工作人员在履行公务期间，擅离岗位，叛逃境外或者在境外叛逃，危害中华人民共和国国家安全的行为。这种行为会直接或间接造成国家的损失，严重危害国家安全。

2、客体要件不同

投敌叛变罪侵犯的同类客体是国家安全，侵犯的直接客体是中华人民共和国公民对国家的效忠义务

叛逃罪侵害的客体是国家安全，即人民民主专政的政权和社会主义制度

3、客观要件不同

投敌叛变罪在客观方面表现为投奔敌方或者敌对营垒，或者在被捕、被俘或者由于其他原因被敌方控制以后投降敌人，危害中华人民共和国国家安全的行为。

叛逃罪在客观方面表现为在履行公务期间，擅离岗位、叛逃境外或者在境外叛逃的行为。(首先，必须是在履行公务期间叛逃，危害了国家安全的，才构成犯罪。其次，必须是擅离岗位叛逃，没有离开自己工作岗位的，不可能成为叛逃行为。第三，要有叛逃行为，包括两个方式：一是在境内履行公务期间叛逃至境外，二是在境外履行公务期间叛逃。最后，叛逃行为必须危害中华人民共和国国家安全，故单纯逃往境外或不回到境内等并不危害国家安全的行为，不成立本罪。)

4、主体要件不同

投敌叛变罪是一般主体，即年满16周岁具有刑事责任能力的人

叛逃罪主体为特殊主体，是国家机关工作人员以及掌握国家秘密的国家工作人员。

5、主观要件不同

投敌叛变罪在主观方面是故意，过失不构成本罪。

叛逃罪是指在主观方面表现为故意，即明知自己的叛逃行为会发生危害国家安全的结果，并且希望或者放任这种结果发生。