分居期间房贷仍由夫妻共同偿还。因为只是分居并未离婚，无论因为什么而分居，也不管分居达到多长时间，只要双方未办理离婚手续，婚姻关系就依法存在，婚姻关系存续双方就对共同债务负有偿还的责任。

一、长期两地分居离婚时的财产债务问题

分居期间一方所得的财产，如没有约定，应当认定为夫妻共同所有，在离婚时进行分割。

分居期间的债务，具体还要看债务产生的原因以及发生债务后取得的财产的用途是什么，夫妻分居期间，一方所负债务，如果用于家庭共同生活的，属于夫妻共同债务，离婚时双方应当共同承担，先用夫妻共同财产偿还债务，共同财产不足清偿的，由双方协议清偿。

二、分居所负债务如何处理

分居后一方所负债务是否属于共同债务，视负债原因而定。

如果一方不堪忍受另一方的虐待、歧视而出走或分居，在分居期间为了生活或为尽法定的赡养、抚养义务、或为治疗疾病等而负的债务，应属于夫妻共同债务，夫妻共同偿还，双方协商不成由法院判决因为夫妻间就存在着法定的相互扶养的义务。

如果分居后的一方是为了生产、经营所负的债务，而其生产经营的收入并未拿来养家或并未用于家庭共同开支的，那么，其经营与生产系个人行为，于其家庭生活无关，为此而所负的债务也属于个人债务，应由其个人清偿。离婚时，另一方没有代为清偿的责任。

三、分居期间一方所借债务算不算共同债务

夫妻分居后一方所欠债务应认定是共同债务，由夫妻进行共同偿还。尽管两人可能分居了较长时间，但分居并未办理离婚手续，未对双方的财产约定其所得财产的归属，也没有第三人知道他们有无约定，因此各自所得的财产应属夫妻共同财产，而债务也应是共同债务。

但有两种例外情况：

1、夫妻一方能够证明债权人与债务人明确约定为个人债务的;

2、夫妻对婚姻关系存续期间所得的财产约定归各自所有的，夫或妻一方对外所负的债务，第三人知道该约定的，以夫或妻一方所有的财产清偿。