1、著作权法只保护作品的形式，而不保护作品的内容，这意味着软件作品的理念不受保护。与传统的书面作品不同，软件作品只是一种算法，一种数学的逻辑组织，一种纯粹的科学原理和抽象公式，是对自然规律的直接反映。不同的软件有着相同的本质，软件之间的差异主要体现在“概念”上。软件作品的思想不受保护，只有作品的表现形式受到保护，即程序代码受到保护？；根据现行著作权法，创作者的“脑力”无法得到保护。这种情况的发生，将大大降低创作者的开发积极性，违背著作权法“鼓励创作”的初衷

第二，著作权法只禁止抄袭，不是两个独立作品的相似性

如何区分两个人独立开发的相似软件；如何用逆向工程分析方法定义他人开发的同类软件；现行著作权法对通过修改或改变语言形式而产生的剽窃、仿制产品的处理方法是茫然不知所措的。优秀的软件独立开发者的合法权益容易受到损害，问题的症结在于软件理念得不到法律的保护

第三，传统著作权法只禁止他人为牟利而复制著作权作品，但并不禁止他人复制某一著作权作品供个人使用，这意味着购买和使用盗版软件不在法律限制的范围内，这是盗版者和侵权者的心病。如果没有法律的限制，就等于“鼓励”。如果盗版市场“合法”发展，软件著作权人的合法权益必然受到侵害

第四，著作权的一个重要内容是作者的修改权，即他人无权修改著作权作品，而计算机软件在使用中需要不断改进，一些修改是不可避免的。根据现行著作权法，修改意味着“侵权”显然是不合理的。著作权保护期限为作者去世前后50年（个人）或50年（单位），但软件产品更新快，寿命短，著作权保护期限过长，不利于软件产品的优化。因此，在实践中，相对于软件作品的著作权保护期限不能起到规范作用