医疗诈骗罪立案后处理流程：诈骗罪立案后公安机关应当立即开始侦查，侦查结束后，认为需要追究刑事责任的，将相关的案卷材料移送至检察院，检察院进行审查，审查结束后，认为需要起诉的向人民法院起诉，人民法院受理后开始审理判决。

法律依据：

《刑事诉讼法》第一百七十二条

人民检察院对于监察机关、公安机关移送起诉的案件，应当在一个月以内作出决定，重大、复杂的案件，可以延长十五日；犯罪嫌疑人认罪认罚，符合速裁程序适用条件的，应当在十日以内作出决定，对可能判处的有期徒刑超过一年的，可以延长至十五日。

人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。

怎么处理医疗诈骗案件

可以通过投诉举报或者是报警的方式处理医疗诈骗案件，立案后，公安机关对报警人进行口供录取，了解情况，之后会收集证据，进行调查。最后确定犯罪嫌疑人，对犯罪嫌疑人进行传讯询问，若犯罪嫌疑人不配合，会进行拘留审讯，这种情况是要掌握足够的证据之后。

公安机关侦查之后，犯罪嫌疑人承认犯罪，公安机关便将案件移送检察院，由检察院审查。检察院审查之后，认为本案可以直接提起公诉的，便向法院提起公诉；若认为本案证据有瑕疵，但确实可以提起诉讼的，将案卷退回公安机关补充侦查，之后再提起公诉；若是由受害人直接提起控告的，检察院认为不予立案的，会自15日内向受害人送达不予立案通知书，告知受害人不予立案的理由和法律依据。