不可以合并审理，商标权与著作权是两种不同的知识产权，分别由《商标法》和《著作权法》予以保护。在实践中，可能发生两种权利冲突的情形，具体是指著作权和商标权都具有合法性，在对两者未进行协调或者处理的情况下，两者之间可能出现的对抗。对于这样的权利冲突，解决的基本原则是“权利在先”原则，即对在先的权利给予保护，而在后的权利可能被认定侵犯在先权利。

申请商标注册不得损害他人现有的在先权利，也不得以不正当手段抢先注册他人已经使用并有一定影响的商标，此处的“在先权利”，即包括了在先成立、生效的著作权。

商标侵权引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。

工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。对五年内实施两次以上商标侵权行为或者有其他严重情节的，应当从重处罚。

一、商标侵权如何赔偿的？

侵犯商标专用权的赔偿数额，有以下几种确定方式：

1、侵权人在侵权期间因侵权所获得的利润。

2、被侵权人在被侵权期间因被侵权所受到的损失，包括被侵权人为制止侵权行为所支付的合理开支。

3、协议赔偿额：侵权人因侵权所得利益，或者被侵权人因被侵权所受损失难以确定，当事人就赔偿数额达成协议的，人民法院应当准许。

4、法定赔偿额：侵权人因侵权所得利益，或者被侵权人因被侵权所受损失难以确定，当事人没有达成协议的，人民法院可以根据当事人的请求或者依职权，根据侵权行为的情节判决给予50万元以下的赔偿。