欧盟市场协调局在对欧共体商标注册申请进行形式审查之后，将与欧盟成员国商标主管部门分别进行实质审查。实质审查通过之后，商标进入公告期。公告三个月内，在先权利人可以提出异议。由于欧盟被认为是一个统一的市场，—旦在任意一国内提出的异议成立，该商标将同样不能在其他国家获得保护。

与此相同，欧共体注册商标的转让、撤销等事项的办理都必须作为整体在所有国家内进行。

如果没有异议或者异议不成立，商标将获得注册并发给注册证书。