根据民法典相关规定，在离婚诉讼过程中，法院判决子女抚养权时，两岁以下子女判决会以女方抚养为优先，但如果有两个子女，则在判决时法院首先鼓励双方进行平等协商，法院会根据双方协商意愿进行判决。若是协商未果，则法院通常会要求父母双方一人一个子女的判决，或是会根据子女的实际情况进行判决。

民法典夫妻离婚两个孩子该如何判

子女抚养权由双方协商，一般以有利于子女成长为原则来分配。孩子年龄较小，随着母亲的可能性较大，一般两个孩子，父母每人抚养一个。如果孩子已经十岁以上，如何分配应考虑孩子的意见。非抚养子女一方有权探望，并且需要支付抚养费，一般以实际收入的20％－30％为限，两个孩子的抚养费比例可以适当提高，但一般情况下不得超过月收入的50％。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条第三款，离婚后，哺乳期内的子女，以随哺乳的母亲抚养为原则。哺乳期后的子女，如双方因抚养问题发生争执不能达成协议时，由人民法院根据子女的权益和双方的具体情况判决。两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。