公司进行股权转让的方式：

1、内部转让的，需经双方基于自愿原则，依法订立转让协议，并办理变更登记；

2、外部转让的，需经转让人提前公告，召开股东大会，并经其他股东过半数同意，待其他股东放弃优先购买权，然后，与受让人订立书面转让协议，并办理变更登记

一、发生股权转让协议纠纷有哪几方面

发生股权转让协议纠纷有以下几方面：

1、部分股东隐瞒并冒充其他股东签订股权转让协议；

2、股权转让协议签订后，出让人不履行协议义务，协助受让人办理工商变更登记或者受让人不履行股权转让款的支付；

3、一方起诉确认股权转让协议无效；

4、隐名股东代替挂名股东签订股权转让协议；

5、有限责任公司股东未经其他股东同意将股权转让给第三方，侵犯其他股东的优先购买权。

二、公司变更股权流程是怎样的？

一、受让股权公司首先应召开公司股东会，研究收购股权的可行性，分析收购股权的目的是否符合公司的战略发展。二、聘请律师进行法律尽职调查。三、出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。四、评估、验资，私营有限公司也可以协商确定股权转让价格。五、股权转让的公司召开股东会，并形成股权转让的有效股东会决议。六、股东之间转让股权的，不需经过股东会表决同意，只要通知公司及其他股东即可。向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决，并形成有效股东会决议。对股权转让给第三方放弃优先购买权的股东，应出具放弃优先购买权的承诺或证明。七、股权转让方与受让方签订股权转让协议。八、召开新股东会议，经过新股东会表决同意，任命新股东的相关职务。九、对公司股东名册进行变更登记，并相应修改公司章程。十、将新修改的《公司章程》，股东及其出资变更等向工商行政管理部门进行工商变更登记。

三、两股份转让协议什么意思

两股权转让协议是指股东与转让签订的部分股权转让协议。根据《中华人民共和国公司法》第七十一条规定，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。