持有ｃ１驾驶证驾驶摩托车扣１２分。根据《道路交通安全违法行为记分分值》的规定，驾驶与准驾车型不符的机动车的，一次记１２分。根据《道路交通安全法》第９９条规定，持有ｃ１驾驶证驾驶摩托车的，由公安机关交通管理部门暂扣摩托车，处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。Ｃ１驾驶证在一个周期内被扣分满１２分的，一般驾驶证会被暂扣，需要驾驶人在１５日内到驾驶证原发证车管所或者违章地车管所报名，参加道路交通安全法规规定的七天学习，完成学习以后，驾驶人应在２０日内参加车管所安排的道路交通安全法规的理论考试，考试合格的，驾驶证扣分清零，考试不合格的，继续学习后再考试，如果不按照规定参加学习考试的，车管所可给予暂停驾驶证。