变造金融机构批准文件罪既遂的处罚，是根据《刑法》第一百七十四条【擅自设立金融机构罪】未经国家有关主管部门批准，擅自设立商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。

【伪造、变造、转让金融机构经营许可证、批准文件罪】伪造、变造、转让商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的经营许可证或者批准文件的，依照前款的规定处罚。

单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照第一款的规定处罚。

一、本罪情节严重的认定

“情节严重”的具体情况由最高司法机关在总结司法实践经验的基础上，通过司法解释予以明确。一般而言，情节严重应包括下列情形：

(1)多次伪造、变造、转让经营许可证或者批准文件的；

(2)伪造、变造经营许可证或者批准文件数量较大的；

(3)伪造、变造经营许可证或者批准文件又出售、出租的；

(4)利用伪造、变造、转让的经营许可证或者批准文件进行经营，严重干扰国家金融秩序的；

(5)利用伪造、变造、转让的经营许可证或者批准文件，进行诈骗的；

(6)利用伪造、变造、转让的经营许可证或者批准文件进行营业，给客户、经营单位造成重大经济损失的或者造成其他严重后果的。

变造金融机构批准文件罪的具体判决和处理情况，应当严格按照上述法律规定的程序来进行认定，特别是对于造成了严重的违法事实的，或者达到了上述法律中规定的情节严重的情况，是需要从严进行判决处理的，具体情况由法院进行判决。