一、什么标准下擅自发行公司债券罪才立案

1、擅自发行公司债券罪的立案标准是：

（1）发行数额在五十万元以上的；

（2）虽未达到上述数额标准，但擅自发行致使三十人以上的投资者购买了公司债券的；

（3）不能及时清偿或者清退的；

（4）其他后果严重或者有其他严重情节的情形。

2、法律依据：

《中华人民共和国刑法》第一百七十九条

未经国家有关主管部门批准，擅自发行股票或者公司、企业债券，数额巨大、后果严重或者有其他严重情节的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处非法募集资金金额百分之一以上百分之五以下罚金。

单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处五年以下有期徒刑或者拘役。

二、公司债券和企业债券有什么差异

1、发行主体不同。

公司债券是由股份有限公司或有限责任公司发行的债券;企业债券是由中央政府部门所属机构、国有独资企业或国有控股企业发行的债券。

2、发行条件不同。

3、发行程序不同。

发行公司债券应当向国务院授权的部门或者国务院证券监督管理机构申请核准。发行企业债券应当报有关部门审批。

4、法律依据不同。

公司债券在《公司法》中有专门一章的规定，同时《证券法》当中也有关于公司债券的规定，而企业债券主要是适用《企业债券管理条例》。

5、定价不同。

公司债券采用核准制，由证监会进行审核，由发行人与保荐人通过市场询价确定发行价;企业债券则是由发改委审核。

6、再次发行的限制不同。