（一）征地补偿标准过低，被征地农民与政府间的矛盾；此类问题由行政职权干预，发生纠纷时通常由政府协调，并可以申请政府裁决。

（二）村集体内部部分小组的承包地被征用，或者各小组被征用土地的比例不一。土地补偿款的分配由全体集体成员共同表决时，侵害了少数被征地农民的权益。

处理农村土地纠纷问题的相关部门有哪些？

我国的土地流转是建立在《中华人民共和国土地管理法》（以下简称《土地管理法》）的法律基础上进行的，《土地管理法》第十六条规定：

“土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。”

《中华人民共和国农村土地承包法》更是为了进一步规范农村土地承包经营权流转，其中第五十一条规定：

“因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解解决。

当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。

第五十二条：

“当事人对农村土地承包仲裁机构的仲裁裁决不服的，可以在收到裁决书之日起三十日内向人民法院起诉。逾期不起诉的，裁决书即发生法律效力。

由此可知，农村土地纠纷首先应该找乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。如果对人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

另外在2005年9月1日起实施的《最高人民法院关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》中对审理涉及农村土地承包纠纷案件中适用法律的家庭承包纠纷案件、其他方式承包纠纷、土地征收补偿费用分配及土地承包经营权继承纠纷等问题进行了解释。