一、犯罪嫌疑人被超期羁押，检察院会怎么处理？

（一）犯罪嫌疑人、被告人及其法定代理人、近亲属或者犯罪嫌疑人、被告人委托的律师及其他辩护人对于人民法院、人民检察院或者公安机关采取强制措施超过法定期限的，有权要求解除强制措施。

（二）人民法院、人民检察院或者公安机关对于被采取强制措施超过法定期限的犯罪嫌疑人、被告人应当予以释放、解除取保候审、监视居住或者依法变更强制措施。

对超期羁押而言，主要是指逮捕后超期羁押，当然也有刑事拘留后的。应当区别情况：1、予以释放；2、依法变更强制措施，改逮捕为取保候审或监视居住。

（三）对超期羁押的案件而言，司法机关一直以来，特别是近几年来，十分强调不得超期羁押，但对具体的承办人并没有什么强有力的措施，这主要是因为：目前我们司法机关办案并不是承办人在独立办案，而是整个司法机关在独立办案，超期羁押的发生不是一个人的责任，是整个单位的责任。在这种情况下，到底该处理谁呢？

（四）对犯罪嫌疑人或被告人而言，则要根据不同的情况，或申请国家赔偿或折抵刑期，也有可能不了了之。就目前而言，对司法机关来说，还是自我约束的层面，禁止超期羁押并没有上升到法律法规的层面来强制执行。

（五）有的单位在案件法定办理期限届满前，按照不同案件的类型，办案人员会提前1到7天收到‘预警通知书’。同时进一步规范退回补充侦查，制定《通知侦查机关提供法庭审判所需证据材料意见书》，通知侦查机关在公诉审查期限内补强证据，以减少退回补充侦查的次数，防止变相延长嫌疑人的羁押期限。

（六）有的单位要求各业务部门内勤建立案件办理台账，加强对案件流程的监控和预警，对即将到期尚未办结的案件，由内勤制发催办函，督促承办人员按期办结。同时要求案件管理中心对内积极发挥对业务部门办案流程的动态监控职能，着重做好办案期限预警通知工作和个案办理“程序回头看”督察工作，建立办案期限预警台账，在案件法定办理期限届满前，针对审查逮捕案件提前1天，针对审查起诉案件提前3天，针对自侦案件提前7天，向承办人发出“预警通知书”，提示办案人员在期限内审结；对外把好案件入口关，发现公安机关移送案件出现超期羁押等程序违法的情形，在案件流转同时向业务部门发出《应予纠正程序违法提示函》，督促业务部门第一时间纠正侦查机关的违法行为。

二、超期羁押投诉部门是哪个

超期羁押投诉部门是法院所在地的纪检监察部门，也可以向当地法院的检察部门监所检察科或民行科举报，或者直接向法院的上一级部门进行投诉。

三、司法机关超期羁押改如何救济

对于超期羁押的案件，根据我国《刑事诉讼法》第75条的规定：“犯罪嫌疑人、被告人及其法定代理人、近亲属或者犯罪嫌疑人、被告人委托的律师及其他辩护人对于人民法院、人民检察院或者公安机关采取强制措施超过法定期限的，有权要求解除强制措施。人民法院、人民检察院或者公安机关对于被采取强制措施超过法定期限的犯罪嫌疑人、被告人应当予以释放、解除取保候审、监视居住或者依法变更强制措施。”因此，可以根据上述法律规定行使权利，可向人民检察院申诉，也可向上一级公、检、法或人大监督机关申诉，要求撤销或变更强制措施，监督改正，以维护合法权益不受侵害。