1、当事人对刑事和解协议书有异议的，人民法院应当审查，并依据实际情况作出处理：

(一)经审查，和解自愿、合法的，予以确认，无需重新制作和解协议书；

(二)和解违反自愿、合法原则的，应当认定无效。

(三)和解协议被认定无效后，双方当事人重新达成和解的，人民法院应当主持制作新的和解协议书。

2、法律依据：《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》

第五百九十条

对公安机关、人民检察院主持制作的和解协议书，当事人提出异议的，人民法院应当审查。经审查，和解自愿、合法的，予以确认，无需重新制作和解协议书；和解违反自愿、合法原则的，应当认定无效。和解协议被认定无效后，双方当事人重新达成和解的，人民法院应当主持制作新的和解协议书。

一、刑事和解的程序有哪些

首先，在刑事案件中，双方当事人要进行和解，需要确定是否属于以下案件：

1、涉嫌侵犯人身权利民主权利、侵犯财产犯罪，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的犯罪；

2、除渎职犯罪以外可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪，并且，犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的不适用。

其次，双方当事人达成刑事和解有以下方式：

1、双方当事人提出和解

双方当事人为避免诉累，可以自发提出和解。不过，自诉案件允许和解，公诉案件还是要接受法院追究刑事责任。

比如故意伤害罪，双方当事人达成赔偿协议后，被告人犯的罪较重的仍然要负担刑事责任。

2、双方当事人亲属、代理人、辩护人代为提出和解

为给被告人争取宽大处理，其亲属、代理人、辩护人也可以根据具体情况，代为提出和解，跟被害人达成一致即可。

3、司法机关告知当事人可以进行和解

对符合刑事和解条件的案件而没有进行和解的，司法机关就会告知对方可以进行和解。