债权债务清查的方法可以使用函证核对法。企业首先要检查本单位各项往来款项账簿记录是否正确和完整，在送对方单位核对。此项目的对帐单的内容可分为两部分，上半部分说明债务的原因、时间以及金额，并进行核对，下半部分是回单，对方单位要在核对的基础上说明是否有误及其有误的金额等。

企业债权债务怎么清算

1、债权人是否可以直接起诉股东。

实践中有债权人直接起诉股东，要求法院判令股东直接承担民事责任，理由是有限责任公司已被吊销营业执照，无法参加诉讼，但是此时公司尚未进行注销登记，企业的法人资格还存在，公司仅以其全部财产为限承担企业债务。

2、债权人是否可以直接起诉未进行注销的公司。

权人认为公司虽被吊销了营业执照，但未被注销，其法人主体资格仍然存在，其仍然可以参加诉讼，如上文所述，企业法人资格仍存在，但是解散之后，企业已经丧失实际的履行能力，对债务应由清算小组进行清算分配。

3、债权人在工商部门不组织清算时可否直接起诉工商部门。

债权人认为应向工商行政管理部门申请组织清算，如果工商行政管理部门再不及时履行行政职责，债权人可提起行政诉讼。被依法责令关闭的公司由有关主管机关组织股东、有关机关及有关专业人员成立清算组，进行清算。工商部门不作为的，应当承担相应的责任。

《中华人民共和国公司法》

第一百八十八条公司注销公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。

第一百八十九条清算组成员的义务与责任清算组成员应当忠于职守，依法履行清算义务。清算组成员不得利用职权收受贿赂或者其他非法收入，不得侵占公司财产。清算组成员因故意或者重大过失给公司或者债权人造成损失的，应当承担赔偿责任。