请求宣告无效的理由主要包括：认为发明创造不具备新颖性、创造性及实用性或同已有外观设计相同或相近似或与他人在先取得的合法权利相冲突；发明或者实用新型说明书中的技术方案所属技术领域的技术人员不能实现；说明书修改超出原始说明书、权利要求书范围，或超出原始图片、照片超出原始说明书、权利要求书范围，或超出原始图片、照片表示的范围；权利要求书没有以说明书为依据说明要求保护的范围；权利要求书中权利要求保护的范围不清楚；独立权利要求缺少必要技术特征；违反国家法律或者不属于专利保护范围等。

一、专利无效行政诉讼中的实体性问题

无效宣告请求人在请求宣告专利权无效或者部分无效的，应当向专利复审委员会提交专利权无效宣告请求书和必要的证据一式两份。无效宣告请求书应当结合提交的所有证据，具体说明无效宣告请求的理由，并指明每项理由所依据的证据。

原告以及代理人的工作是针对被告在证据采信、事实分析和法律适用上的缺陷，根据法律的规定作出分析和陈述，说服法院采信自己的观点。原告代理人对于实体问题的质疑和要求司法审查则主要可以针对以下问题进行：

1、对证据的采信是否违反法律对于证据的一般规则或特别规则的规定、对于证据的不采信是否违反法律的有关规定；

2、适用法律是否超出了无效宣告请求人的理由范围；

3、适用法律是否与对证据的分析相一致等。

二、专利无效行政诉讼中的程序合法性是什么

1、是否应当通知当事人出席口头审理而没有通知；

2、是否应当回避的审查员没有回避或者没有参加口审的审查员却参加了审查决定的作出；

3、当事人出庭人员是否符合法律规定，授权是否有瑕疵，双方当事人对出庭人员有异议而没有被复审委员会接受等。

被告在行政处理案件的过程中，程序是否合法是这类行政案件审理的关键问题，也是代理人在诉讼中的代理要点之一。