小股东可以通过以下措施和制度保护自己的权利：（1）可以查阅公司会计账簿。（2）可以申请人民法院确认股东会、董事会决议无效，或申请撤销股东会、董事会决议。当股东会、董事会的召集程序，表决方式违反法律、行政法规规定或者公司章程，或者决议内容违反公司章程时，股东可以自作出决议之日起60日内请求人民法院予以撤销。（3）可以要求退股。公司连续5年盈利，并符合公司法规定的分配利润条件，但不向股东分配利润的，对股东大会该项决议投反对票的股东可以要求公司以合理价格收购其股权。股东与公司不能达成股权收购协议的，股东可以向人民法院提起诉讼。（4）特殊情况下股东可以申请法院解散公司。（5）可以提起直接诉讼。（6）可以提起股东代表诉讼。当公司董事、经理等高级管理人员或者公司以外的他人侵犯了公司权益，给公司造成了损失而公司不予追究时，股东可以以自己的名义依法向人民法院提起诉讼，以维护公司和自身的权益。

小股东权益的保护措施

（一）建立公司内部有效的权利制衡机制。

1、进一步强化监事会的权利，并赋予监事会在特殊情况下为保护公司利益可以采取的应对措施。

2、限制大股东的表决权。《公司法》规定，公司修改章程、增减注册资本、分立、合并、解散、或者变更公司形式，须经代表三分之二以上表决权的股东通过。

3、对董事会的经营权加以制约。

（二）强化小股东在股东大会的提议权。

《公司法》第43条规定，代表四分之一以上表决权的股东，三分之一以上董事，或者监事，可以提议召开临时股东大会。明确小股东的诉讼权力：

1、扩大小股东的可诉范围；根据《公司法》第111条的规定，小股东在股东大会、董事会的决议违反法律、行政法规，侵犯股东合法权益的，小股东可以作为原告向法院起诉。

2、规定诉讼时效；《公司法》应就此增加诉讼时效之规定，具体时间以十五天为宜，因为公司决议效力的未决状态影响公司的运作。

3、调查权；当小股东有正当理由怀疑公司存在违反法律和章程的行为时，可以请求法院或主管部门调查公司的经营状况。

《中华人民共和国公司法》第二十二条公司股东会或者股东大会、董事会的决议内容违反法律、行政法规的无效。股东会或者股东大会、董事会的会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程的，股东可以自决议作出之日起六十日内，请求人民法院撤销。股东依照前款规定提起诉讼的，人民法院可以应公司的请求，要求股东提供相应担保。公司根据股东会或者股东大会、董事会决议已办理变更登记的，人民法院宣告该决议无效或者撤销该决议后，公司应当向公司登记机关申请撤销变更登记。