随着卡的发放，市内各定点医疗机构将设“东莞市社会保障卡诊疗一卡通服务平台”，参保人持在市内各定点医疗机构门诊就医，就可通过该平台中的“东莞市社会保障卡诊疗一卡通自助服务系统”(以下简称“自助服务系统”)，实现上述各项功能。

社保卡医疗应用功能首先在已具备相应条件的市内定点医疗机构中逐步推广使用，随着应用功能不断完善，最终实现全市使用。目前已开通使用的定点医疗机构有：市人民医院、太平人民医院、市中医院、石龙人民医院、东华医院、康华医院、虎门医院及寮步社区卫生服务中心、石碣社区卫生服务中心。