一、合作协议和合作合同的区别是什么

协议的定义：机关、企事业单位、社会团体或个人，相互之间为了某个经济问题，或者合作办理某项事情，经过共同协商后，订立的共同遵守和执行的条文。

与合同的区别是：

1、合同有违约责任的规定，协议书没有。

2、经济合同有合用法作为依据，协议书暂时没有具体法规规定。

3、协议书比合同应用范围广，项目往往比合同项目要大，内容不如合同具体。因此，协议书签订以后，往往还要分项签订一些专门合

二、合作合同的法律规定

合作双方的约定只能在法律允许的范围内，不能约定属于禁止投资的领域或行业；不能约定名为合作企业合同实为借款合同；不能约定逃避税收；不能约定违反外汇管理方面的规定，否则可能导致所签合同内容违法而无效。

合资、合作合同是一种特殊性质的合同，通常涉及到双方重大经济利益，必须依法经政府主管部门批准才能生效。我国《中外合资经营企业法》、《中外合作经营企业法》均规定，合营企业的协议、合同和章程经审批机构批准后生效，可见审批机构的批准是合营企业合同生效的必经程序，只有经过批准，合同才算有效成立，未经批准合同无效。

三、合作合同的注意事项

1、合同的基本条款要具备，尤其是交易的内容、履行方式和期限、违约责任要约定清楚。

2、查阅国家对该交易有无特别规定，目的在于确定双方的权利义务是否合法有效。

3、向律师事务所、公司法律顾问咨询相关业务的实际开展情况，了解业务发生纠纷的概率和纠纷的起因、种类，以便在订立合同时尽可能避免同样缺憾的发生。

4、可能的话，通过行政机关的公证、律师见证和公证，通过相关机构的中介作用，使合同的内容尽可能完备。

5、签署合同时合同表面要字迹清楚，整洁，推荐使用合同专用纸张打印。