承包费数额标准问题是农村土地承包合同纠纷中最为普遍、也最为突出的问题，也多为纠纷形成的根源。在承包费的数额约定上，双方签订合同时没有一个具体的参照标准，难以有一个准确、恰当的把握。例如承包的荒地，承包前可以说没有什么收益，签合同时约定的承包费数额很低。但承包后，由于承包人进行了诸如建厂搞养殖业等投资经营，有了很大的收益，发包方便打破承包费数额的约定，单方擅自增加承包费，由此酿成纠纷。承包费应以什么标准确定?是以承包前的土地实际收益情况来衡量，还是应以承包后承包人的实际经营收益情况来确定?法律没有明确的规定，双方也很少在合同中就此予以约定。

往往表现为，在合同履行过程中，发包方擅自提高承包费的数额，如果承包方不同意，发包方往往通过给承包方经营设置障碍诸如采取断电、停水等手段迫使承包方就范，使承包方处于两难的境地;如果同意增加承包费数额，担心发包方往往在这个问题上没有限度;如果不接受发包方增加承包费数额的意见，则又会面临承受不起经济损失的局面。承包费过低似不公平，而水涨船高没有限度，显然也不利于个体私营经济的经营积极性。反过来说，如果承包方经营效益差乃至亏损，此种情形下承包费数额能否降低标准予以减交或免除?此类问题仍是审理农村承包合同纠纷案件中一个难以把握和值得研究的问题。