电动自行车上牌后闯红灯，不会扣驾驶证的分。非机动车或者行人闯红灯被当场逮住会按地方的处罚力度大小对其做出以教育为目的并以罚款的形式来做出处理；按所描述的电动车（属于非机动车）违反交通法规，不会扣机动车驾驶证的分数，机动车驾驶证的一切内部相关行为只适用于机动车。

开未上牌电动自行车发生交通事故，如何认定责任和赔偿

超过电动自行车是机动车还是非机动车，需要通过鉴定方式确认。开未上牌超标电动自行车，经过鉴定为机动车的：

1、在非机动车道和自行车发生事故，会被界定为机动车与非机动车发生事故，未上牌的超标电动自行车要负全责。

2、如果是在机动车道发生交通事故，会被界定为机动车与机动车之间发生事故，保险范围之外按责任比例承担赔偿。因超标自行车没有买保险，因此车主需要自己承担赔偿费用。

3、喝酒开未上牌超标电动自行车，被交警检查后，认定为醉酒驾驶的，那么醉酒驾驶机动车，车主将会被是追究刑事责任。

《中华人民共和国道路交通安全法》第八十九条行人、乘车人、非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者五元以上五十元以下罚款；非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的，可以扣留其非机动车。