法人代表合同签字瑕疵的处理方法：首先取决于合同当事人的约定，若当事人约定“合同自双方盖章并经法定代表人签字生效”，则两条件必须同时具备方为有效。如果合同没有特殊约定，那么加盖公司公章或者法定代表人签字都是有效的。

一、合同甲方没签字有盖章有效吗

合同甲方没签字有盖章没有效。合同当事人在合同上签字是就有法律效力的，法律没有规定合同签字一定要配合盖章才生效，如企业的代表人在合同上签字，但是没有加盖企业公章，合同也是有效的。但是如果双方在合同中有明确的规定，合同在签字后必须要加盖公章之后才生效，那么只有企业的法定代表人签字，没有加盖企业公章的，合同不具有法律效力。

二、合同约定与实际履行不符以哪个为准

合同约定与实际履行不符时，以实际履行为准。在一般情况下，劳动合同自双方当事人签字之日起生效。如果双方当事人根据特定的需要，在劳动合同中对生效的期限或者条件作出特别约定的，那么当事人约定的时间或条件一旦成立，劳动合同即生效。生效时间不应早于签字时间。劳动合同没有约定生效时间的，以当事人签字或者盖章的时间为生效时间。当事人签字或者盖章时间不一致的，以最后一方签字或者盖章的时间为准。

三、合同未签字盖章有效吗

合同未签字盖章无效。因为法定代表人代表法人行使职权，以法人名义作出的行为由法人承担，加盖公章不是合同有效的必要条件。根据《中华人民共和国民法典》规定，代表法人行使职权的负责人是法人的法定代表人。法定代表人代表法人行使职权，以法人名义对外作出的行为由法人承担盖公章不是合同有效的必要条件。另外，合同无效的情形有五种，法定代表人在合同上签字，不加盖公司公章的，不是规定的。因此，法定代表人在合同上签字，不加盖公司公章，合同有效。