根据《农村土地承包法》关于农村土地承包经营权流转的相关规定，最高人民法院《关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》(法释〔2006〕6号)等法律政策，对农户已流转的承包地应区分不同情况进行确权登记颁证：

1、以互换、转让方式流转的承包地，流转双方签订书面流转合同的，由当事人向村组集体经济组织提出申请，按照合同约定，对土地流出户办理土地承包经营权注销登记，将流转土地承包经营权确定给土地流入农户，并予以确权登记颁证;没有书面协议的，由双方就土地流转意向达成一致，补签土地流转合同后，由当事人向村组集体经济组织提出申请，按照合同约定，对土地流出户办理土地承包经营权注销登记，将流转土地承包经营权确定给土地流入农户，并予以确权登记颁证;对土地互换有争议的，待争议解决后再确权登记颁证。

2、以转包、出租、入股等方式流转的承包地，土地承包经营权归原承包农户，以原承包农户为承包经营权主体，按照原有农村土地承包关系，依法确权登记颁证。