妨害传染病防治罪立案标准如下：

(一)供水单元供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的；

(二)拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、粪便进行消毒处理的；

(三)准许或者纵容传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的；

(四)拒绝执行疾病预防控制机构遵照传染病防治法提出的预防、控制措施的。

一、疫情期间偷着上课怎么处理呢

疫情期间偷偷上课属于违反相关防疫措施要求，打乱国家防疫安排，可能构成妨害传染病防治罪。接受疾病预防控制机构、医疗机构有关传染病的调查、检验、采集样本等措施是一切单位和个人的法定义务。所以，疫情期间偷偷上课属于违法行为。如果因疫情期间偷偷上课的行为产生严重后果的，如引发病毒传播等，则触妨害传染病防治罪，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。

二、为查找传染病病因，法律规定医疗机构可以怎么做

为查找传染病病因，法律规定医疗机构可以的做法是对传染病疫情进行流行病学调查，根据调查情况提出划定疫点、疫区的建议，对被污染的场所进行卫生处理，对密切接触者，在指定场所进行医学观察和采取其他必要的预防措施，并向卫生行政部门提出疫情控制方案。