企业在处理无形资产时，要注意如下问题：

(1)如果有条件，应争取高新技术企业的认定，可以享受税收等方面的优惠政策;

(2)尽量申请专利、著作权、商标权等法律保护形式，并应注意加强商业秘密、技术秘密的保密措施;

(3)在股东以经营性资产出资或收购经营性资产时，要注意纳入相关的无形资产;

(4)如果商标、专利等方面有许可他人使用或被许可使用等协议安排，协议应规范;

(5)可以通过间接方式纳入无形资产，但程序要合法、规范。