可以跨区办理港澳通行证。根据国家移民局发布信息，自2019年4月1日起，中华人民共和国普通护照、往来港澳通行证、往来台湾通行证等出入境证件实行“全国通办”，即内地居民可在全国任一出入境管理窗口申请办理出入境证件，申办手续与户籍地一致。

一、在内地怎么办理港澳通行证

异地办理港澳通行证的方法：1、登录当地的出入境管理办事大厅网站进行预约。2、预约完成后，在预约的时间到达出入境管理大厅，按照现场的流程进行办证。目前我国有43个城市允许非本市户籍人员办理港澳通行证，但要满足一定的条件，否则你只能回户籍所在地办理。(一)、就业非本地户籍人员：申请往来港澳通行证预约需要在当地省的出入境管理官网申请预约办理。就业人员(登记备案国家工作人员除外)要本人带户口簿+复印件、二代居民身份证+复印件、一年或以上有效的本市居住证、连续一年本市社保证、照片+照片回执去市出入境厅办理。(二)、非本地户籍在校学生：在高等院校在读的非本市户籍大学生，本人持户口簿、二代居民身份证、学校出具的证明和学生证、照片+照片回执去市出入境厅办理。

二、办理港澳通行证异地可以办理吗

可以异地办理，办理时要带上本人身份证原件，港澳通行证照片以及居住证到当地出入境部门办理。港澳通行证，俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。

三、内地去澳门需要什么手续

公民若需要前往澳门，是需要到当地出入境部门申请办理港澳通行证以及澳门签注以后，再可以过关前往。港澳通行证初次办理，需要本人带上有效的身份证原件，港澳通行证照片到当地出入境部门申请办理（异地居住需要提供当地居住证），一般7天内可以出证（异地办理大概需要30天），港澳通行证初次办理需要缴纳证件费用100元，一次签注20元。