按照以往的做法参考如下：

1、分批转运，分批报关，分批结汇，分批核销。

如果你是网上核销，金额（我们这里的分批限制在2000美金），超过5000美金，那就一批批核销，差额原因就填：运保杂费。

2、部分地方退税申报有90天的规定（从报关、核销到申报退税的时间规定），应该在规定时间内核销；

3、通过网上核销，先在网上申报核销，拉出申报单，单位签章，核销人员签名；其次附上核销单、报关单和对应的银行拉单。（以前还需要发票）

如果报关金额与银行拉单不符，以报关单为主。

报关单大于银行拉单，差额再取第二批装运结汇拉单（在申报的时候也要把差额填上）；报关单金额小于银行拉单，申报的时候按报关的金额输入，余下的差额下次核销。