功能上的区别：

1、电子护照在签发和管理模式上与之前传统护照的区别在于：电子护照里面嵌入了一块智能芯片，芯片上记录了护照持有人的个人信息，其中包括生物信息。生物信息有较好的抗模仿性，例如，指纹和眼红膜等难以被模仿或修改，防伪性能有极大提高。

2、电子护照安全系数高，不易被伪造。在制作电子护照时，有关信息被加密存储至芯片中，具有难以被篡改的数字安全性，让“不法图谋者”无法找到可乘之机。

3、电子芯片具有相当高的信息存储量。护照持有人的相片经过数字化分析后，将形成“面相特征”数据存储在芯片中。当持有人出入境时，关口会再次对持有人现场照相，并与芯片中储存的数据进行比对，减少了判别护照真伪时对肉眼的依赖

外观上的区别：

在外观设计上，电子普通护照采用了以“辉煌中国”为主题的图案元素，并采用常光、荧光及水印三种图案形式共同表现主题。其中常光、荧光图案分别选择了31个省、自治区、直辖市及香港、澳门、台湾具有地域性代表的元素进行设计，并通过“天安门”、“长城”、“天坛”等3个代表国家形象的元素进行联接;整个图案设计恢宏大气、蕴意深刻，既展示了我国的自然风貌，又展现了我国源远流长的历史文化和中华民族和谐统一的精神理念。