法律虽规定房产过户税费的纳税义务人为出卖方，但并不禁止当事人在房产交易过程中自行约定相关税费的承担主体。二手房买卖合同双方当事人对交易过程中的税费负担未约定或约定不明，经协商不能达成补充协议的，应按照税务部门对各类税种及纳税义务人的明确规定确定税费承担人。

一、商业用房房产税征收流程

（一）根据细则，购房人向主管税务机关申报减免房产税认定时，应如实填写房产税认定申报表，并提交房产交易合同（包括新建商品住房的房屋交接书）。

新购住房的契税完税凭证，购房人及其家庭成员的有效身份证明，购房人的户籍（或居住）证明和婚姻状况证明，无住房同住人及其家庭成员的有效身份证明、户籍证明和婚姻状况证明（申请计入无住房同住人的提供）等资料。

（二）购房人提交资料后，从主管税务机关领取《原有住房信息查询申请表》，向房屋状况信息部门查询原有住房情况，并将取得的原有住房书面查询结果送主管税务机关。

1、主管税务机关收到购房人提供的原有住房书面查询结果后的10个工作日内，根据审核认定结果，向购房人签发《上海市个人住房房产税认定通知书》。

2、主管税务机关可根据需要会同住房保障房屋管理、建设交通、规划国土资源、公安、民政、人力资源社会保障等部门复核购房人提供的有关信息。

（三）此外纳税人应当在每年的12月31日前，凭有效身份证明原件自行向主管税务机关申报缴纳税款，缴清当年度应纳税款。未按时足额缴纳的，逾期缴纳的税款从次年1月1日起按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。

二、卖家需支付的税费有哪些

1、卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：房地产交易手续费3元／平方米。

2、印花税：房屋产价的0．05％。

3、土地税：可提供上手购房的，土地税＝［转让收入－上手价（每年加计5％）－有关税金］×适用税率。不能提供上手购房的，土地税＝（转让收入－转让收入×90％）×30％。

4、个人所得税：据实征收为（转让收入－房产原值－合理费用）×20％，核定征收为转让收入×7．5％×20％。转让收入－房产原值－合理费用相当于个人净收入。

5、营业税及附加税：可提供上手购房的，为（转让收入－上手价）×5．5％。不能提供上手的，为转让收入×5．5％；税费为差额的5．56％。

6、土地出让金：商业用途用房，按其网格点基准地价的35％计收；商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价的10％；用途用房按其网格点基准地价的30％计收。

7、土地出让金契税：按本次征收土地出让金价款的3％征收。