公司实际出资额大于注册资本是可以的，当实际出资额大于注册资本时可以通过以下方法处理：1、可以通过增资扩股变更工商登记的注册资本信息，重新划分出资份额比例；2、可以将超出注册资本的部分划为公司向股东借款，通过其他应付款核算。

股东投入土地使用权出资有哪些规定？

（一）出资条件

第一，土地出资的是使用权而非所有权；

第二，用于出资的土地使用权，必须是国有土地，而且经过有偿出让；

第三，用于出资的土地使用权应未设权利负担。

出资人以划拨土地使用权出资公司，或者以设定权利负担的土地使用权出资，公司、其他股东或者公司债权人主张认定出资人未履行出资义务的，人民法院应当责令当事人在制定的合理期间内办理土地变更手续或者解除负担；逾期未办理或者未解除的，人民法院应当认定出资人未依法全面履行出资义务的风险。

（二）履行方式

履行方式包括交付和产权登记是土地使用权出资行为不可分割的两个方面。

法条链接：

出资人以房屋、土地使用权或者需要办理权属登记手续的知识产权等财产出资，已经交付公司使用但未办理权属变更手续，公司、其他股东或者公司债权人主张认定出资人未履行出资义务的，人民法院应当责令当事人在制定的合理期间内办理权属变更手续；在前述期间内办理了权属变更登记手续，人民法院应当认定其已经履行了出资义务；出资人主张自其实际交付财产给公司使用时享有相应股东权利的，人民法院应予支持。出资人以前款规定的财产出资，已经办理权属变更手续但未交付给公司使用，公司或者其他股东主张其向公司交付，并在交付之前不享有相应股东权利的，人民法院不予支持。

（三）税费成本

（1）营业税

以无形资产、不动产投资入股，与接受投资方利润分配，共同承担投资风险的行为，不征收营业税。对股权转让不征收营业税。

（2）土地增值税

以土地投资、联营的，如果被投资、联营的企业从事房地产开发的，被投资人和以土地投资的投资人均应当缴纳土地增值税；如果被投资、联营的企业为非从事房地产开发的，或者说呗投资、联营的企业从事房地产开发的，被投资人和以土地投资的投资人均应当缴纳土地增值税。

（3）企业所得税

土地资产出资超过账面价值的部分应根据规定缴纳企业所得税。

法条链接：

《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第二十五条：企业发生非货币性资产交换，以及将货物、财产、劳务用于捐赠、偿债、赞助、集资、广告、样品、职工福利或者利润分配等用途的，应当视同销售货物、转让财产或者提供劳务，但国务院财政、税务主管部门另有规定的除外。

（4）印花税

根据印花税规定，财产所有权的转移应当按“产权转移书据”税目征收印花税，其计税价格应当以评估机构估价为依据。

”股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。对作为出资的非货币财产应当评估作价，核实财产，不得高估或者低估作价。法律、行政法规对评估作价有规定的，从其规定。

因此股东如果想要投入土地到使用权，他出资就只能够出资土地的使用权部分，而不能够出资土地的所有权，因为国有土地的所有权是属于国家的，而农村里面他的土地的所有权相对应的是属于到集体的，但是有一部分它也是属于国家的，总之要想出让也必须只能经过有偿出让。

《中华人民共和国公司法》第一百七十八条有限责任公司增加注册资本时，股东认缴新增资本的出资，依照本法设立有限责任公司缴纳出资的有关规定执行。股份有限公司为增加注册资本发行新股时，股东认购新股，依照本法设立股份有限公司缴纳股款的有关规定执行。