1、发放年终奖的当月工资高于3500元时，再发放的年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。年终奖扣税方式为：年终奖＊税率－快速扣除，税率按年终奖／12作为应纳税所得额。年度一次性奖金，单独作为一个月计算时，除以12找税率，但计算税额时，速算扣除数只允许扣除一次。2、当月工资低于3500元时，年终奖单独作为一个月的工资计算缴纳个人所得税。个人所得税年终奖＝（年终奖－（3500－月工资）＊税率－快速扣除，税率按年终奖－（3500－月工资）除以12作为应纳税所得额。但全年一次性奖金可以减去员工当月工资薪金所得与费用扣除额的差额后的余额，作为应纳税所得额。其中，员工当月工资薪金所得按收入扣除规定标准的免税所得（如按规定缴纳的社会保险、住房公积金等）后的金额。

年终奖扣税计算公式

1、如果雇员当月工资薪金所得高于（或等于）税法规定的费用扣除额的。

适用公式为：应纳税额＝雇员当月取得全年一次性奖金适用税率－速算扣除数；

2、如果雇员当月工资薪金所得低于税法规定的费用扣除额的。

适用公式为：应纳税额＝（雇员当月取得全年一次性奖金－雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额）适用税率－速算扣除数。