注册资本的印花税是只交一次。印花税是对合同、凭证、收据、账簿及权利许可证等文件征收的税种。纳税人通过在文件上加贴印花税票，或者盖章来履行纳税义务。印花税的税率为万分之五，如果股东改变涉及股东股权转让，应缴纳万分之五的印花税。

注册资本增加交印花税有什么优惠政策吗

根据《印花税暂行条例施行细则》（［1988］财税字第255号）第八条的规定，记载资金的账簿贴花后，以后年度资金总额比已贴花资金总额增加的，增加部分应按规定贴花。

因此，若该企业确有证据证明2013年已按100万元缴纳过印花税，那么2015年增资时只需按10万元缴纳印花税。

中华人民共和国印花税法第十二条

下列凭证免征印花税：

（一）应税凭证的副本或者抄本；

（二）依照法律规定应当予以免税的外国驻华使馆、领事馆和国际组织驻华代表机构为获得馆舍书立的应税凭证；

（三）中国人民解放军、中国人民武装警察部队书立的应税凭证；

（四）农民、家庭农场、农民专业合作社、农村集体经济组织、村民委员会购买农业生产资料或者销售农产品书立的买卖合同和农业保险合同；

（五）无息或者贴息借款合同、国际金融组织向中国提供优惠贷款书立的借款合同；

（六）财产所有权人将财产赠与政府、学校、社会福利机构、慈善组织书立的产权转移书据；

（七）非营利性医疗卫生机构采购药品或者卫生材料书立的买卖合同。