申请组合贷款被银行、卖方拒绝。说到底，还是因为组合贷款涉及了公积金中心、银行等多家机构，在流程上会慢一些，一般申贷周期为2-3个月以上，卖房人要等上这2、3个月才能拿到尾款，着急用钱的肯定不愿意等。从银行的角度看，出于对风险的考虑，一套房产不能同时抵押给两家银行，所以不愿意接受组合贷款业务。

公积金贷款受开发商歧视。正如上面所说，组合贷款申贷周期相对较长，不仅买二手房会遇到阻碍，买新房的时候也会遭到开发商嫌弃，因为申贷周期越长，对于开发商来说回笼资金越慢，承担的风险也越高。

缴存时间有要求。不仅是申贷时间，公积金的缴存时间也会影响房贷申请。多地公积金管理中心对缴存时间的要求都是：申请贷款时贷款申请人连续足额缴存公积金6个月(含)以上，且公积金账户处于缴存状态。也有城市仍要求连续缴存12个月(含)以上才能贷款。不少人跳槽换工作时没有考虑到公积金断缴问题，导致之后因为缴存时间的问题，导致无法申请公积金贷款买房。

公积金账户余额不足影响贷款额度。有的城市确实把公积金账户余额作为计算贷款额度的条件之一，比如广州规定：贷款额度=账户余额*8+月缴存额*到退休年龄月数，账户余额太少，能申请到的贷款额度也就越低，达不到期望值自然会影响买房。当然，并不是所有城市都会考查账户余额，但是要满足连续缴存一定时间的要求才能申请贷款。