社保断缴超过三个月，处理如下：

1、医疗保险、生育保险的缴费年限将重新计算。一般医疗保险和生育保险的缴纳年限在计算时是不能出现连续三个月的断缴的。

2、影响医疗保险的报销。如果断缴超过三个月，在续交后，至少需要连续缴纳6个月才可进行医疗保险的报销。

社保断缴超过两年可以补吗

社保断缴超过两年可以补，具体如下：

1、但灵活就业人员只能缴纳基本养老保险和基本医疗保险。参加基本养老保险从参保之月起缴纳基本养老保险费，不得向前补缴；

2、职工医保缴费年限累计计算，参保人员停保或断保后，续保时可补缴停保或断保期间的医疗保险费，缴费年限连续计算。若是用人单位断交社保两年的，自欠缴之日起需要交纳滞纳金。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第五十八条

用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。

自愿参加社会保险的无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，应当向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。

国家建立全国统一的个人社会保障号码。个人社会保障号码为公民身份号码。

第五十九条

县级以上人民政府加强社会保险费的征收工作。

社会保险费实行统一征收，实施步骤和具体办法由国务院规定。

《社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。