公司申请软件著作权登记申请文件应当包括：软件著作权登记申请表、软件的鉴别材料、申请人身份证明和相关的证明文件各一式一份。

1、软件著作权登记申请表（表格1份）

2、软件（程序、文档）的鉴别材料.

一般交存：源程序和文档应提交前、后各连续30页，不足60页的，应当全部提交；

例外交存：请按照《计算机软件著作权登记办法》第十二条规定的方式之一提交软件的鉴别材料。注：源程序和文档应在页眉上标注相应的软件名称和版本号，右上角应标注页码，源程序每页不少于50行，文档每页不少于30行。

3、有关证明文件证明文件包括：申请人及代理人的身份证明文件、权利归属证明文件等。

①代理人身份证明登记申请委托代理的，应当提交代理人的身份证明文件复印件，申请表中应当明确委托事项、委托权限范围、委托期限等内容。

②有效身份证明文件（单位的需盖公章）.企业法人单位提交有效的营业执照副本的复印件；.事业法人单位提交有效的事业法人证书的复印件；.社团法人单位提交民政部门出具的有效的社团法人证书的复印件；.其他组织提交工商管理机关或民政部门出具的证明文件复印件；.自然人申请的，提交身份证或护照等有效证明的复印件。

③权利归属的证明文件.委托开发的,应当提交委托开发合同；.合作开发的,应当提交合作开发合同；.下达任务开发的,应当提交上级部门的下达任务书；.受让取得软件著作权的,应当提交软件著作权转让协议；.原著作权人的企业被合并或分立，由合并或分立后的其他企业享有著作权的，需要提交的证明文件包括：企业注销登记证明、股东会或董事会决议等其他证明；.继承人继承的，需要提供的证明文件包括：被继承人的死亡证明、被继承人有效遗嘱、与被继承人的关系证明、继承人身份证明、法院的法律文书等。

4、其他证明文件.修改他人软件应当授权许可的，应当提交授权书。

以上就是天津软件著作权申请流程的回答。