改革包括三方面内容：

1、建立出口货物直通放行制度,改造升级CIQ2000系统，按照低风险、可控制原则，统一制定出口直通放行货物目录,对于出口产品免验企业、实施绿色通道制度企业、出口分类管理中的一类企业等，经产地局检验检疫合格后直接签发通关单，实现出口货物直通放行。

2、建立进口货物直通放行制度,对于直通放行的货物，口岸局受理报检并签发通关单，将报检信息发送至目的地检验检疫机构，货物由目的地检验检疫机构实施检验检疫，实现直通放行。

3、开发完善、建立健全一整套技术、行政保障措施，既实现放得快，又保证管得住、管得好,全面推进与海关的通关单电子联网核查，建立电子底账，实现通关数据的可追溯性，启用报检单位和报检员管理系统的诚信管理功能，强化企业诚信意识。