日本国内的大学和国内大学一样，也分为很多种类，这里说的分类不是按学术性质分类，而是分位语言学校和大学预科等学习日语的教育机构。大学学部(本科)和大学院(研究生)、短期大学、专修学校等高等教育机构。按照留学的时间和签证的申请方式分1年以上的长期留学和1年以内的短期留学。另外按照留学经费分类的话可以分为获得各类奖学金的公费留学和个人出资的自费留学。这些留学方式都是全日制或上、下午半天制。

课程上的区别

A、日语学校和大学别科的区别

日语学校是指经日语教育振兴协会认定的日语教育机关，大学别科是指大多数私立大校及短期大学在校内为进入本校为目标的学生以实施日语教育为目的课程。日语学校和大学别科在机能方面近似。两者主要区别为学习时间、课程的设置，以及升学时的辅导的不同。

B、大学和短-大、专修学校的区别

大学和短-大、专修学校都是以高中毕业为入学条件的高等教育机构，但学习的年限、获得的学位资格、教学内容以及人才培养的目的有所不同。大学中除医科、牙科、兽医科是6年以外，其它都是4年制，毕业时可以获得学士学位。短期大学是2年制，可以获得准学士。专修学校主要是以2年为主，可以获得专业士称号。一般来说，大学是以学习知识为重点，专修学校以学习技能为重点。短-大则介于前两者之间。

C、“研究生”和大学院生的区别

“研究生”与中文的研究生是不同意思的，它是指在研究生院及大学里，以研究课题为基础，进行学习的旁听生，是不授予学位的。中文的研究生相当于日本的修士课程的大学院生。大学院生是指在研究生院已获得学位为目标的学生，一般分为2年硕士课程以及3年博士课程。近年来由于研究生的学习时间可以作为考大学院的准备时间，所以希望成为研究生的留学生有所增加。