工厂拆迁补偿肯定是针对工厂来说的，补偿是对厂子被拆迁而补偿给工厂的，就是为了叫你用来安置回迁的当然也包括新建厂房，至于转到公司，一般而言如果工厂和公司都是被拆迁方所有，是可以转到公司的，这要根据实际的情况而定。如果不是同一人所有，补偿费用是不可以随便转到公司的，也违反了相关的法律法规。

拆迁补偿款要交什么税

（一）营业税

被拆迁单位和个人因拆迁取得的房屋（或土地）拆迁补偿费及其他补助费或补偿安置的房屋，除下列两种情况外，均应征收营业税。

（二）土地增值税

根据《土地增值税暂行条例》第8条规定，因国家建设需要依法征用、收回的房地产免征土地增值税。

《土地增值税暂行条例实施细则》第11条进一步规定：此处所称的因国家建设需要依法征用、收回的房地产，是指因城市实施规划、国家建设的需要而被政府批准征用的房产或收回的土地使用权。

《国有土地上的房屋征收与补偿条例》（以下简称《征收与补偿条例》）第十七条的规定：“作出房屋征收决定的市、县级人民政府对补征收人给予的补偿包括：

（一）被征收房屋价值的补偿；

（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；

（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。市县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。”