1、投资主体不同：个人独资企业：指有一个投资主体并且是个人出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。合资企业：指有两个或两个以上的投资主体共同出资，按照有关规定在工商行政部门登记注册开办的企业。2、经营方式不同：个人独资企业：是一个人投资独立经营。合资企业是两个或两个以上的投资主体合作经营．3、利润分配形式不同：个人独资企业是投资者个人自主经营，自负盈亏。合资企业投资者（两个或两个以上的人）共同经营，按出资比例，分享成果，共担风险。4、投资人人数不同。个人独资企业的人数仅为一人，合伙企业为二人以上。5、责任承担有所不同。个人独资企业仅由出资人一人承担无限责任，合伙企业则由全体合伙人承担连带无限责任。

自然人独资公司与个人独资公司的区别

自然人独资，也称个人独资，是企业的一种组织形式。个人独资企业，简称独资企业，是指由一个自然人投资，全部资产为投资人所有的营利性经济组织。独资企业是一种很古老的企业形式，至今仍广泛运用于商业经营中，其典型特征是个人出资、个人经营、个人自负盈亏和自担风险。

《中华人民共和国个人独资企业法》第八条设立个人独资企业应当具备下列条件：（一）投资人为一个自然人；（二）有合法的企业名称；（三）有投资人申报的出资；（四）有固定的生产经营场所和必要的生产经营条件；（五）有必要的从业人员。