土地承包合同纠纷管辖地应参照不动产纠纷管辖地来确定，由土地所在地人民法院管辖。根据我国《民事诉讼法》第三十三条的规定，下列案件，由本条的规定的人民法院专属管辖：（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。土地是典型的不动产，因为其承包合同产生的纠纷，依法在土地所在地的法院处理。当然，被告所在地法院也是有管辖权的。

民法典土地承包合同纠纷是否会适用诉讼时效

1、土地承包合同纠纷同样适用诉讼时效。根据《民法典》规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

2、民法典对农村土地承包合同纠纷如何处理没有作出规定，土地承包纠纷可以通过协商、调解、诉讼等方式解决。

《民事诉讼法》第三十三条下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖；（二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖；（三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。