不会有影响的。可以去查下婚姻登记中心的存底，如果有存底的，就是有效的，也许仅仅是工作失误，不影响结婚证的合法有效。没有存底的，就是假的。这个情况属于工作失误，本人已经结婚，这个是合法有效的。结婚不是单凭结婚证的，在公安机关的户口信息都已经改成已婚了，建议慎重处理。例如：夫妻吵架把两本结婚证烧了。结婚证虽然没有了，但他们的夫妻关系仍然合法有效。

合同不清楚怎么办？

合同约定的不清楚，可由双方协商，订立补充协议，无法协议补充的按照合同的有关条款或者交易习惯来确定，仍无法确定的，按照具体的规定进行确定。

合同约定不明时应当遵循以下处理原则：

1、当事人协议补充原则；

2、按照合同有关条款或交易习惯确定原则；

3、法定补充原则。

《中华人民共和国民法典》第一千零四十九条要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。